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  • 172020/02

    置 顶Nature||单细胞转录组测序和ATAC-Seq联合解码人类大脑海马体体发育与形成机制

    海马体位于大脑丘脑和内侧颞叶之间,属于边缘系统的一部分,在信息编码、短时记忆、长时记忆、空间导航等方面发挥着重要作用,而且海马体和癫痫、智力障碍、阿尔茨海默病等多种病理的发病机制密切相关。但是目前对于人类海马体的发育与分子特征仍然缺乏清晰地认识。今天小编为大家先容一篇2020年1月15日中科院生物物理研究所研究员王晓群团队联合北京师范大学吴倩团队联合发表在Nature上的一篇关于人类大脑海马体发育的文章,深入探究并揭示了海马体动态变化的发育过程以及记忆功能环路形成的分子机制。文章信息:题目:DecodingthedevelopmentofthehumanhippocampusDOI:10.1038/s41586-019-1917-5

  • 162020/01

    置 顶烈冰招聘||大侠,请留步!

    企业先容上海烈冰生物医药科技有限企业(NovelBioBio-PharmTechnologyCo.,Ltd),是一家以生命科学研究与应用开发为发展方向的高新技术企业,专注于新一代高通量测序技术和生物信息学分析应用的开发和推广。烈冰科技主营业务涵盖科研服务、云计算和转化医学三大领域,并通过科研业务确保技术时刻处于国际领先水平,通过基于互联网IT技术支撑的云计算为更多用户提供高效智能的系统平台,最后通过转化医学技术将基因和信息技术真正用于社会广大百姓的健康。截止目前,全国超过1000家顶尖科研机构、医院和医药企业的5000多项重要项目都得益于烈冰先进的分析平台和高度定制化数据解决方案。招聘岗位方案咨询顾问30人实验专员15人技术支撑6人

  • 152020/01

    置 顶烈冰助力||16s rRNA测序揭示神经肽Y1受体拮抗剂调节大鼠肠道菌群并缓解去卵巢导致的骨质疏松症状

    绝经后骨质疏松症(Postmenopausalosteoporosis,PMO)是最常见的原发性骨质疏松症,是由于绝经后雌激素缺乏导致的骨强度降低和骨脆性增加。肠道菌群与骨代谢密切相关,肠道细菌过度生长的患者骨密度明显降低。而神经肽Y(NeuropeptideY,NPY)可以通过Y1受体(Y1R)对肠道直接起到抗菌的作用。那么,NPY能否通过调节大鼠肠道菌群,发挥抗骨质疏松作用呢?肠道菌群与骨代谢之间是如何进行作用的呢?2019年12月6日,上海交通大学医学院附属仁济医院李展春课题组和肖洁课题组利用去卵巢(OVX)大鼠模型,应用Y1R拮抗剂治疗,观察到Y1R拮抗剂能通过调节肠道菌群,发挥抗骨质疏松作用。烈冰科技在该工作中提供了16S

  • 102020/01

    置 顶烈冰单细胞浏览器教你完美解读ScRNA-Seq数据分析结果

    烈冰单细胞浏览器教你完美解读ScRNA-Seq数据分析结果相信很多小伙伴在攻克九九八十一难做完分析时,是这样的,满心期待来看结果时,却变成了这样。l面对大量繁琐的分析结果文件时,说不清理还乱;l想要获得每个Cluster中基因表达量原始信息而翻遍整个文件夹?l想得到不同Marker基因的FeaturePlot?一遍遍的写代码重跑RDS着色?l为了得到配色满意、符合文章发表要求的图片,耗费大量的时间和精力来修图,严重推迟文章发表进度。现在这些统统都不是问题!!小编帮你轻轻松松解决!!无需复杂的PS操作,轻松一键得到满意的细胞类型鉴定t-SNE图(图1右),留下大把的时间去挖掘深层次的生物学意义!!![i1]图1细胞类型鉴定前(左)、后

  • 062020/01

    置 顶烈冰助力||单细胞RNA测序鉴定半月板祖细胞并揭示半月板退变机制

    半月板在关节稳定、减震、接触力分布和关节润滑等方面起着重要作用,其包含不同的细胞类型,主要包括软骨细胞形态细胞和纤维细胞形态细胞。然而,半月板的细胞类型组成、分布和相应的生物标志物,以及治疗半月板退变的生物靶点仍不清楚。2019年12月7日,中山大学附属第一医院廖威明教授课题组和张志奇教授课题组通过ScRNA-Seq详细描绘半月板的细胞组成,鉴定出一种在半月板组织工程中具有应用前景的祖细胞,并证明了半月板的退变机制。并且通过TGFβ1治疗有效缓解半月板退变提出一种半月板退变的潜在治疗策略。此次研究工作中的单细胞RNA测序实验与数据分析由烈冰科技参与支撑。该研究成果以“Single-cellRNA-seqanalysisidentif

  • 042019/11

    置 顶scRNA-Seq数据分析之SCENIC分析—寻找细胞群体中的驱动基因

    SCENIC分析是对ScRNA-Seq数据中转录因子(Transcription Factors,TFs)进行研究,最终筛选得到调控强度显著、处于核心作用的TFs,结果通常以热图形式展示。

  • 302019/10

    置 顶单细胞转录组测序数据分析之拟时序分析

    拟时序分析,即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况,构建细胞谱系发育,但这里的时间并不是真时间,而是一个虚拟的时间,是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。

  • 302019/09

    置 顶单细胞转录组测序数据分析(二)

    通过标准化将数据过滤后通过PCA降维,并形成t-SNE可视化结果;降维后的矩阵进行细胞聚类分析,并计算出各类群的marker基因及表达量,以鉴定所属的细胞类型。

  • 302019/09

    置 顶单细胞转录组测序数据分析(一)

    对scRNA-Seq的数据预处理(质控、细胞数量判断、多样本数据合并)进行先容。

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